יש מלגות מועטות ביותר ללימודים במסלולים לרפואה משלימה או אלטרנטיבית. זאת כי עיקר הקרנות של המלגות פונה ללימודים אקדמיים המוכרים על-ידי המל"ג בישראל. הלימודים במסלולים לרפואה משלימה אינם מוכרים בארץ, אף אחד מהמסלולים. מלגות אפשריות שקיימות למסלולים אלו ניתן לקבל דרך המכללות עצמן.